Създавате файл /etc/apt/apt.conf със съдържание (ако имате такъв файл добавяте в него следното):
Acquire::http::Proxy “http://адрес_на_проксито:порт/”;
За wget:
Във файла /etc/wgetrc намирате следните редове и ги редактирате така:
# You can set the default proxies for Wget to use for http and ftp.
# They will override the value in the environment.
http_proxy = http://адрес_на_проксито:порт/
ftp_proxy = http://адрес_на_проксито:порт/